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Caracterización parcial de un potexvirus aislado de musa coccinea afectada por rayado necrótico en colombia

Se observaron síntomas de rayado necrótico en las hojas de una planta de Musa coccinea (banano escarlata), procedente de Antioquia (Colombia). Mediante inmunocaptura, transcripción reversa y reacción en cadena de la polimerasa (IC-RT-PCR), se amplificó un fragmento de aproximadamente 377 pares de bases, con una identidad de secuencia de aminoácidos de 57% con el gen de la cubierta proteica del Alstroemeria virus X [AlsVX, AB206396] del género Potexvirus. Este es el primer reporte de un potexvirus en M. coccinea. El análisis comparativo de la 3'UTR del potexvirus aislado de M. coccinea con el correspondiente del AlsVX muestra que estos dos virus difieren significativamente en esta región, lo que sugiere que el potexvirus aislado de M. coccinea en Colombia es una nueva especie del género Potexvirus. Se propone el nombre de virus de la raya necrótica del banano escarlata (Scarlet banana necrotic streak virus [SBanNSV]) para este virus aislado de M. coccinea en Colombia

Changing nutrient stoichiometry affects phytoplankton production, DOP accumulation and dinitrogen fixation – a mesocosm experiment in the eastern tropical North Atlantic

Ocean deoxygenation due to climate change may alter redox-sensitive nutrient cycles in the marine environment. The productive eastern tropical North Atlantic (ETNA) upwelling region may be particularly affected when the relatively moderate oxygen minimum zone (OMZ) deoxygenates further and microbially driven nitrogen (N) loss processes are promoted. Consequently, water masses with a low nitrogen to phosphorus (N : P) ratio could reach the euphotic layer, possibly influencing primary production in those waters. Previous mesocosm studies in the oligotrophic Atlantic Ocean identified nitrate availability as a control of primary production, while a possible co-limitation of nitrate and phosphate could not be ruled out. To better understand the impact of changing N : P ratios on primary production and N2 fixation in the ETNA surface ocean, we conducted land-based mesocosm experiments with natural plankton communities and applied a broad range of N : P ratios (2.67–48). Silicic acid was supplied at 15 µmol L−1 in all mesocosms. We monitored nutrient drawdown, biomass accumulation and nitrogen fixation in response to variable nutrient stoichiometry. Our results confirmed nitrate to be the key factor determining primary production. We found that excess phosphate was channeled through particulate organic matter (POP) into the dissolved organic matter (DOP) pool. In mesocosms with low inorganic phosphate availability, DOP was utilized while N2 fixation increased, suggesting a link between those two processes. Interestingly this observation was most pronounced in mesocosms where nitrate was still available, indicating that bioavailable N does not necessarily suppress N2 fixation. We observed a shift from a mixed cyanobacteria–proteobacteria dominated active diazotrophic community towards a diatom-diazotrophic association of the Richelia-Rhizosolenia symbiosis. We hypothesize that a potential change in nutrient stoichiometry in the ETNA might lead to a general shift within the diazotrophic community, potentially influencing primary productivity and carbon export

Confirmada la presencia de la enfermedad del rayado del banano en cultivos de plátano (Musa AAB Simmonds), caña de azúcar (Sacharum officinarum) y achira (Canna edulis) en Colombia.

El objetivo de la investigación fue determinar el agente causal del rayado del banano, enfermedad desconocida en Colombia, la cual se encuentra afectando a cultivos de plátano del clon Dominico-Hartón (Musa AAB Simmonds). La sintomatología observada en este estudio, en las hojas de plátano del clon Dominico-Hartón, es similar a la causada por la enfermedad del rayado del banano. Los síntomas detectados en las hojas de plátano se caracterizan por un rayado clorótico y necrótico. El análisis serológico DAS-ELISA realizado a diferentes órganos de plantas de plátano afectadas por el BSV, mostró que el virus se puede encontrar afectando hojas, seudotallos y pecíolos. El control del badnavirus se puede realizar mediante el establecimiento de nuevas plantaciones de plátano y banano, usando material certificado libre de BSVAchira-Canna indicaBanano- Musa acuminata - Musa paradisiacaPlátano-Musa sapientu

Partículas flexuosas de aspecto viral aisladas de achira (canna edulis ker.) afectada por clorosis en colombia

Observaciones al microscopio electrónico de extractos de hojas de achira (Canna edulis) afectada por una clorosis, precedente del departamento del Huila (Colombia) revelaron la presencia de partículas flexuosas de aspecto viral de aproximadamente 600 nm x 10 nm. Este es el primer reporte de partículas flexuosas de aspecto viral infectando a achira en Colombia

Caracterización parcial de un potexvirus aislado de <i>Musa coccinea</i> afectada por rayado necrótico en Colombia

<p align="justify">Se observaron síntomas de rayado necrótico en las hojas de una planta de <i>Musa coccinea</i> (banano escarlata), procedente de Antioquia (Colombia). Mediante inmunocaptura, transcripción reversa y reacción en cadena de la polimerasa (IC-RT-PCR), se amplificó un fragmento de aproximadamente 377 pares de bases, con una identidad de secuencia de aminoácidos de 57% con el gen de la cubierta proteica del <i>Alstroemeria virus X</i> [AlsVX, AB206396] del género <i>Potexvirus</i>. Este es el primer reporte de un potexvirus en <i>M. coccinea</i>. El análisis comparativo de la 3'UTR del potexvirus aislado de <i>M. coccinea</i> con el correspondiente del AlsVX muestra que estos dos virus difieren significativamente en esta región, lo que sugiere que el potexvirus aislado de <i>M. coccinea</i> en Colombia es una nueva especie del género <i>Potexvirus</i>. Se propone el nombre de virus de la raya necrótica del banano escarlata (<i>Scarlet banana necrotic streak virus</i> [SBanNSV]) para este virus aislado de <i>M. coccinea</i> en Colombia. </p&gt

Caracterización del Gen de la Proteína de Dos Aislamientos del Virus del Mosaico del Pepino (CMV), Obtenidos de Plátano y Banano (Musa spp)

The final objective of this study is to genetically engineer cucumber mosaic virus (CMV) resistance in edible Musa spp.in Colombia, by means of expressing the CMV coat protein gene in transgenic plants. This strategy has been successfully employed in other crops. CMV was serologically detected in leaves of commercially grown bananas (cv. Gros Michel) and plantains (cv. Dominico-Harton) showing mosaic symptoms. CMV was partially purified from infected tissue of Nicotiana tabacum. Transmission electron microscopy examination showed the presence of viral isometric particles of approximately 30 nm in diameter. The molecular weight of the coat protein subunit was approximately 28 kDa as determined by SDS-PAGE. Analysis of double-stranded RNA (dsRNA) indicated that the isolations present in both varieties had similar dsRNA profiles, characteristic of CMV. cDNA was reverse transcribed using viral dsRNA as the template, and the coat protein genes (CPG) of the two CMV isolates were amplified by the polymerase chain reaction (PCR). The amplified products of approximately 890 bp, containing the CPG, were cloned into the plasmid vector Bluescript KS (+/-). Based on the pattern obtained from the digestion of the amplified CP genes with Msp 1 and DNA sequencing data, the two CMV isolates were classified into the serotype subgroup I (typified by isolate DTL). Computer analysis of DNA sequences of the CP genes derived from both CMV isolates showed a 99% homology between them at the nucleotide and amino acid level as well as a high level of conservation with other members of the CMV subgroup I. The CPG of CMV are now being cloned into plant transformation vectors for their genetic engineering into banana and plantain commercial cultivars.El presente estudio se adelantó dentro de un proyecto de investigación para obtención de plantas resistentes al virus del mosaico del pepino (CMV), mediante la transformación y expresión del gen de la proteína de la cápside de CMV en plantas transgénicas de variedades comerciales de plátano y banano (Musa spp). Se trata de una estrategia reciente que ha sido utilizada con éxito en varios cultivos comerciales. El CMV fue detectado serológicamente (DAS-EUSA) en hojas de plátano cv. Dominico Hartón y de banano cv. Gros Michel que presentaban síntomas de mosaico. El virus se purificó parcialmente a partir de hojas infectadas de Nicotiana tabacum y con la ayuda del microscopio electrónico de transmisión, se identificaron partículas isométricas de aproximadamente 30 nm dc diámetro. El peso molecular de la proteína de la cápside en geles desnaturalizados de poliacrilamida (SDS-PAGE) fué de 28 kDa. El patrón electroforético del RNA viral de doble cadena (dcRNA) fué similar para los dos aislamientos de CMV obtenidos de plátano y banano. Utilizando la dcRNA como patrón, se sintetizó cADN por transcripción reversa y, a partir de éste, se amplificaron por PCR los genes de la proteína de Ia cápside (GPC) de ambos aislamientos. Los productos de la amplificación de aproximadamente 890 pares de bases (pb), que contenían el GPC, se donaron en el plásmido vector Bluescript KS (+/-). El análisis de restricción con endonucleasas y la secuenciación del GPC de ambos aislamientos, indicó que éstos pertenecen al subgrupo I (tipificado por el aislamiento DTL). El análisis de la secuencia nucleotídica y de aminoácidos de ambos genes, indicó una homología del 99% y un alto grado de conservación con otros miembros del subgrupo I de CMV. El GPC se está donando en plásmidos vectores para su transformación en variedades comerciales de plátano y banano en Colombia.